गिरिजा व्यास ने इसके बाद ही खुद चिट्ठी लिखकर पूरे मामले में वस्तुस्थिति जाननी चाही है।

राष्ट्रीय महिला आयोग (एनसीडब्ल्यू) ने एंटी टेररिस्ट स्क्वैड (एटीएस) द्वारा मालेगांव ब्लास्ट मामले में आरोपी साध्वी प्रज्ञा सिंह ठाकुर के उत्पीड़न और अमानवीय बर्ताव के आरोपों को बेहद गंभीरता से लिया है। महिला आयोग ने इस मुद्दे पर महाराष्ट्र के मुख्यमंत्री को चिट्ठी लिखकर सफाई मांगी है। राष्ट्रीय महिला आयोग की अध्यक्ष गिरिजा व्यास ने महाराष्ट्र के मुख्यमंत्री अशोक चव्हाण को लिखी चिट्ठी में एक हफ़्ते में पूरे मामले पर जवाब मांगा है। आरोप है कि 10 अक्टूबर से 23 अक्टूबर के बीच एटीएस की हिरासत में साध्वी के साथ बुरा बर्ताव किया गया। गौरतलब है कि राष्ट्रीय महिला आयोग की एक सदस्य एस.चटर्जी की इसी मामले में महाराष्ट्र के डीजीपी ए.एन.राय और महाराष्ट्र के चीफ सेक्रटरी जॉनी जोसफ को चिट्ठी लिखकर 'फैक्चुअल रिपोर्ट' की मांग की थी। लेकिन एक महीने बीत जाने पर भी उसका कोई जवाब नहीं मिला। समझा जाता है कि गिरिजा व्यास ने इसके बाद ही खुद चिट्ठी लिखकर पूरे मामले में वस्तुस्थिति जाननी चाही है। इससे पहले गुजरात कमिशन फॉर विमिन और नैशनल कमिशन फॉर ह्युमन राइट्स (एनएचआरसी) ने भी महाराष्ट्र सरकार से साध्वी के खिलाफ ज़्यादातियों पर सफाई मांगी है।